Itä-Suomen yliopiston yliopistokollegio on valinnut hallituksen uudeksi jäseneksi TSVn toiminnanjohtaja, MuT Lea Ryynänen-Karjalaisen. Hänet valittiin yliopistoyhteisön ulkopuoliseksi jäseneksi FT Riitta Mustosen tilalle. Mustonen erosi hallituksesta siirtyessään Turun yliopiston kehitysjohtajaksi.

Hallitus päättää yliopiston toiminnan keskeisitä tavoitteista ja strategiasta. Itä-Suomen yliopiston hallituksessa on 10 jäsentä, joista neljä on yliopistoyhteisön ulkopuolelta. Hallituksen puheenjohtajana toimii Ilmatieteen laitoksen pääjohtaja Petteri Taalas. Hallituksen toimikausi on 1.1.2014-31.12.2017.